नैनी सेंट्रल जेल में 2,060 कैदियों को रखने की क्षमता है। वर्तमान में 4,275 कैदी नैनी सेंट्रल जेल में बंद हैं। जेल के अंदर बड़ी संख्या में कैदियों के कोरोना पीड़ित होने के बाद उनके खानपान में बदलाव किया जा रहा है तथा पहले से अधिक प्रोटीनयुक्त व डाइट दी जा रही है ताकि कोरोना के संक्रमण से उन्हें बचाया जा सके। जेल में कोरोना बचाव के लिए कैदियों का वैक्सीनेशन भी कराया जा रहा है। अब तक लगभग 19 हजार कैदियों का कोरोना टेस्ट कराया जा चुका है। फिलहाल जेल में बंद कैदियों को कोरोना संक्रमण से बचाना नैनी सेंट्रल जेल प्रशासन के लिए बड़ी चुनौती बना हुआ है।