नोटबंदी के फैसले के लिए केंद्र सरकार के फैसले का शुरू से विरोध करने वाली बनर्जी ने ट्वीट करके कहा कि नोटबंदी से देश में वित्तीय अराजकता और आपदा जैसी स्थिति है। उन्होंने कहा कि मैं खुद कालाधन, भ्रष्टाचार के खिलाफ हूं लेकिन मैं इसके कारण आम लोगों और छोटे व्यापारियों को हो रही परेशानियों से काफी चिंतित हूं।