सबसे पहले मक्का आटा छान लें। अब मैथी को अच्छी तरह से धो लें। आटे में मैथी, सौंफ, हींग, लाल मिर्च पावडर, हरी मिर्च और नमक डालकर आटे को मिला लें। अब गुनगुने गरम पानी से नरम आटा गूंथें।
गूंथे हुए आटे से आवश्यतानुसार लोई बनाएं और हाथ की सहायता से थपथपाकर बेल लें। अगर ज्यादा जरूरत हो तो बेलन का प्रयोग करें। तवा गरम करके रोटी डालें और दोनों तरफ से सेकें।
सेंकते समय दोनों तरफ से घी या तेल लगाएं और कुरकुरी होने तक सेंक लें, तत्पश्चात साग, कढ़ी या चटनी के साथ गरमागरम मैथी-मक्की की मिस्सी रोटी पेश करें।