मेनल का वीजा समाप्त हो गया था : चिंता को और बढ़ाते हुए सीआरपीएफ ने कहा कि मेनल का वीजा समाप्त हो गया था और अधिकारियों को सूचित करने के बजाय अहमद ने बल को सूचित किए बिना उसे दीर्घकालिक वीजा (एलटीवी) के लिए आवेदन करने में मदद की। पहलगाम आतंकवादी हमले के बाद यह मुद्दा और भी गंभीर जांच के दायरे में आ गया, जब सरकार ने भारत में रहने वाले सभी पाकिस्तानी नागरिकों को निर्वासित करने का आदेश दिया। इसी दौरान मुनीर अहमद कथित तौर पर अपनी कानूनी स्थिति का खुलासा किए बिना 6 दिनों की छुट्टी पर चले गए थे।
दस्तावेज पर उनके हस्ताक्षर जाली थे : सीआरपीएफ ने यह भी तर्क दिया कि निकाहनामे में उस तारीख का जिक्र था, जब मेनल खान कथित तौर पर पाकिस्तान में ही थी जिससे यह संकेत मिलता है कि दस्तावेज पर उनके हस्ताक्षर जाली थे। बल ने जोर देकर कहा कि अहमद अपने पद के कारण संवेदनशील स्थानों और संचालन संबंधी जानकारी तक पहुंच रखते थे और उनके कार्यों से सुरक्षा में संभावित सेंध लग सकती थी, खासकर ऐसे समय में जब पाकिस्तान को एक शत्रुतापूर्ण राष्ट्र माना जाता है।
अपने बचाव में मुनीर अहमद ने बर्खास्तगी को चुनौती दी है और अपने साफ-सुथरे सेवा रिकॉर्ड, अपनी शादी की योजनाओं के बारे में सीआरपीएफ अधिकारियों के साथ पूर्व संवाद और अपनी पत्नी के लिए वीजा नियमितीकरण के समर्थन में भाजपा सांसदों के पत्रों का हवाला दिया है। उनका तर्क है कि उनके कार्यों से किसी भी स्पष्ट आचरण नियम का उल्लंघन नहीं हुआ और बर्खास्तगी अनुचित थी। हालांकि सीआरपीएफ का कहना है कि यह मुद्दा सेवा आचरण से परे राष्ट्रीय सुरक्षा के दायरे में आता है जिसके लिए उनके अनुसार शून्य सहनशीलता की आवश्यकता है।